В чём, по-вашему несовместимость Базарова и Одинцовой?

они люди разных слоев общества, она дворянка, он нигилист, и хотя у них есть общие темы для разговора, вместе жить они бы не смогли

Вот говорят: "разные, они разные! ", а кому когда эта разность мешала любить?? ? Я думаю, что проблема в том, что Одинцова просто не смогла полюбить. Ее первый муж внушил ей какое-то стойкое отвращение к противоположному полу на подсознательном уровне, кроме того, жизнь она свою менять не захотела. Есть там одна такая сценка, когда подул на нее ветер из окна, а она прикрыла его как ни в чем не бывало. Так и с Базаровым: пытался он на нее "подуть",а она как от сквозняка, от него отвернулась...