Большинство самых распространенных русских фамилий (а Ильин – в их числе) ведут свое начало от имен. Вот и в данном случае Илья (в переводе с древнееврейского – ‘мой Бог’) и его производные формы – в основе всех нижеперечисленных фамилий: Илейкин, Илиев, Иллич, Ильиничнин, Ильинский, Ильиных, Ильичёв(ов), Ильченко