Какую экологическая проблема существует в городе (где воздух не сильно загрязнён) , чтобы ещё на основе биоиндикаторов...

Сред вообще существует: воздушная, водная, почвенная, организменная, как то что-то типо того... Точно сказать сейчас не могу. Выдерете любую среду, например, водную или почвенную, измерте значение любого вещества в нем ПДК которого ВЫ знаете и постройне сравнительную диаграмму, тоже самое с помощью биоиндикаторов можно. Их спектр также разнообразен, в зависимости от среды и примерной климатической характеристи места проведения опыта.

как сотрудник лаборатории предлагаю маленького рака в качестве биоиндикатора http://blogs.mail.ru/mail/begemot1971/6704D841C4B30FCB.html