Отличается ли качество работы антивируса в фоновом режиме от режима "по заказу" ?

да - но это зависит от того что вы изменили в настройках антивиря - если улучлили строгость сканирования - будет больше контролировать работу пк но и настраивать нужно уметь а то настроите что на комп зайти не сможете - а если уменьшите настройки безопасность - то можно и вирус словить - лучше оставть в фоновом режиме если толком настроить несможете - как говорится ни мне и не тебе