Почему калининградцы восприняли провозглашение Литвой независимости с озабоченностью?

Потому что с географической точки зрения Калининградская область оказалась "отрезанной" от территории России Литвой. Эта область - самая западная часть России и граничит с Литвой и Польшей. Теперь, чтобы выехать (въехать) на территорию Калининградской обл. из России нужна транзитная  виза через территорию стран ЕС.