Курсовая работа: Теоретические основы использования компьютерных программ в биологии

Меню Просмотр (View)

Показать/Спрятать панель инструментов или строку статуса

Чтобы показать панель инструментов (Tool Bar) или строку статуса (Status Bar), выберите название панели инструментов, нажмите на нем и рядом появится галочка. Чтобы спрятать панель инструментов, снимите в списке галочку 􀀻 рядом с интересующей панелью.

Инструменты (Tools) Используйте эту команду для вызова панели дополнительных инструментов в окне. С помощью этих инструментов можно определить положение определенной точки на изображении 􀃉, нанести линию нужной толщины 􀀇, стереть нанесенные пометки с изображения с помощью «резинки», нанести прямоугольник 1 или круг 􀁣, нанести текст А, вставить стрелку, определить цвет, растянуть/сжать изображение, масштабировать изображение, повернуть изображение вертикально ↕ или горизонтально ↔, сбросить все нанесенные пометки и изменения 􀁔. Некоторые из этих инструментов дублируются на панели инструментов (Tool Bar). Уменьшить (Zoom out)

Используйте эту команду для последовательного двукратного уменьшения изображения в окне.

Увеличить (Zoom in) Используйте эту команду для последовательного двукратного увеличения изображения в окне.

Сетка (Grid) Накладывается на изображение для подсчета процентного отношения выбранной части ко всему изображению. Обычно используется для изображений, которые тяжело анализировать с помощью модуля Фазовый Анализ/Сегментация вследствие невозможности разделения по яркости и монохромным оттенкам. Доступны сетки 5x5, 10x10, 100x100 линий. Чтобы убрать сетку, нажмите Отменить или выберите Remove Grid (Убрать сетку) в блоке управления размером сетки.

Гистограмма (Histogram) Гистограмма показывает, какие особенности яркости/контраста присутствуют на изображении. Изображение с низким контрастом будет иметь гистограммы, сконцентрированные около ограниченного участка цветовой плоскости изображения. Изображение в оттенках серого будет иметь гистограмму с отмеренными градациями серого (0–255) по оси X. 24-битное цветное изображение имеет гистограммы отдельно для каждого канала – Красного (Red), Зеленого (Green), Синего (Blue).

Во весь экран (FullScreen) По этой команде окно программы разворачивается во весь экран. Для возврата к прежнему виду надо снять «галочку» напротив этого пункта Full Screen.

Меню изображение (Image) Масштабировать (Zoom) Используйте эту команду для изменения размера отображения изображения на экране монитора. Возможно масштабирование от уменьшения в 4 раза (25%) до увеличения в 4 раза (400%) от исходного. Команда Original Size возвращает изображение к оригиналу. Использование этой функции не приводит к изменению реального размера отображения исходного изображения. Для того, чтобы изменить размер исходного изображения используйте функции Resize и Rotation.

Отражение (Flip) Используйте эту команду для зеркального отражения изображения. Возможно отражение изображения горизонтально, вертикально, в обоих направлениях.

Повернуть (Rotation) Используйте эту команду для поворота изображения. Когда изображение вращается на углы, кратные 90°, то размеры нового изображения подгоняются под исходное изображение. Возможно многократное вращение, наряду с однократным вращением на углы 90°, 180°, 270°, 360° и любой произвольный угол.

Оттенки серого (Gray Scale) Используйте эту команду для преобразования цветного изображения в оттенки серого.

Распыление (Spray) Многие образцы имеют посторонние включения, которые вносят помехи в результаты анализа. Выберите команду Распыление и медленно устраните посторонние включения вплоть до слияния с фоном. Этот инструмент может также использоваться для изображений с более темной периферией. Выберите цвет с правильно освещенного участка и затем распылите его на темную часть до тех пор, пока на всем изображении фон станет однородным.

Камера-люцида (Camera Lucida) Инструмент заменяет стандартную камеру камерой-люцида для получения линейной диаграммы изображения. Выберите Камера-люцида, медленно проведите линию на объекте, и нажав Применить, получите линейную диаграмму, которую затем можно сохранить на диске для дальнейшего использования.

Изменить размер (Resize) Используйте эту команду для получения нового изображения из текущего, но с новыми размерами. Этот процесс фактически меняет пространственное разрешение, добавляя или удаляя пиксели для получения новых размеров.

Монтаж (Alpha Blending) Этот инструмент полезен для использования с образцами, имеющими несколько фокусов, которые не могут быть получены одновременно. Захватываются несколько фокусов, и два из них открываются в этом модуле. Яркость устанавливается на уровне, дающем хороший результат просмотра. Сохраните это третье изображение, и можно продолжать процесс далее для любого количества изображений.

Alpha Blending – взвешенное наложение смешиваемых цветов.

Меню примечания (Annotation) Используйте эту опцию для нанесения текста и графических изменений на изображение. Когда вы выберете эту команду, на экране появится панель инструментов для рисования. Для удобства выполните Увеличение / Уменьшение, Изменение Размера / Отражение.

Карандаш (Pencil) В зависимости от вашего выбора, этот инструмент позволяет нанести линию или фигуру. По нажатию на правую кнопку мыши можно выбрать необходимый размер линии, а также цвет из палитры.

Ластик (Eraser) Ластик применяется для стирания на изображении инструментов Кисти, Стрелки, Прямоугольника, Эллипса, Текста. Само исходное изображение не затрагивается.

Прямоугольник (Rectangle) Используйте этот инструмент для рисования прямоугольников (контуров). Чтобы нарисовать прямоугольник, нужно нажатием левой кнопки мыши определить положение левого верхнего угла, и, не отпуская кнопку, определить правый нижний угол фигуры. По нажатию на правую кнопку мыши можно выбрать толщину линий, цвет можно выбрать из панели Цвет.

Эллипс (Ellipse) Этот инструмент рисует эллипсы и окружности. После нажатия левой кнопки мыши перемещайте курсор до тех пор, пока не получится фигура нужной формы и размеров. По нажатию на правую кнопку мыши можно выбрать толщину линий.

Цвет можно выбрать из панели Цвет.

Текст (Text) Нажмите левую кнопку мыши для определения точки на изображении, с которой нужно вводить текст. Выберите цвет, шрифт, размер и т.д. и введите текст.

Нажмите ОК для вставки текста на изображение.

Стрелка (Arrow) Стрелка может быть вставлена в любое место изображение с любым направлением и любого размера и цвета. Доступны опции Заполненная / Незаполненная. При нажатии ОК вставьте стрелку на требуемое место в изображении.

Цветовая палитра (Color Palette) Применяется для изменения цвета Маркера, Стрелки, Текста, Камеры-люцида, Сетки, линий в измерениях.

Меню калибровка (Calibration) Необходимо откалибровать все объективы микроскопа, на котором установлена цифровая камера. Без этого невозможно проведение измерений объектов. Это нужно сделать после того, как настроено все оборудование и программное обеспечение. При изменении настроек или при смене частей оборудования, калибровку нужно произвести заново. После установки программы на компьютер все измерения производятся в точках изображения – пикселях. Для получения результатов измерений в реальных единицах измерения – сантиметрах, микронах, миллиметрах и т.д. необходимо провести калибровку системы. В процессе калибровки определяется размер пикселя при рабочем увеличении системы в выбранных единицах измерения. Вы можете сделать калибровки для всех увеличений, которые будете использовать в работе. Например, если Вы работаете с микроскопом, откалибруйте все рабочие объективы.