Что такое специальная дисциплина?  

Смотря что имеется ввиду. если речь идет о программе учебногог заведение (колледжа или ВУЗа), то специальные дисциплины - те дисциплины, которые предполагают получение навыков и знаний по данной специальности (собственно то, что отличает получение данной специальности от других на факультете или ВУЗе)