Что чувствует природа, при попытках открывать её тайны?

Это называется антропоморфизмом - наделение живой и неживой природы человеческими чертами. Здравый смысл подсказывает, что природе (особенно неживой) всё равно кто мы есть и что делаем. С другой стороны, значительное вмешательство в природу, нарушение её саморегуляции приводит к экологическим катастрофам от которых страдает и сам человек. Тайна - это человеческая выдумка, она не материальна. Я уверен, что природе всё равно, знаем ли мы состав лунного грунта или законы квантовой физики. Природа в целом это не разумное существо, это система, круговорот веществ и энергии. И чтобы ей не навредить, надо её активно изучать и более осознанно защищать от себя самих.

Мне кажется ей это совсем не нравится.

Смотря на намерение. Хотя есть тайны, которые реально использовать только в благих намерениях, тогда природа сама идет на встречу.

Природа, как настоящая женщина, все тайны не открывает.