Доказательство родства живой природы

Основных два. Первое (и главное): единство генетического кода.  Для всех живых существ триплетный код одинаков. Второе: филогенетическая преемственность. Всегда можно показать, "что, как и откуда" возникло, в рамках СТЭ (Синтетическая Теория Эволюции). И, наконец, палеонтология + сравнительная анатомия. Тут ещё общность клеточной теории (клетка лишь от клетки). Но это только дополняет первое и второе.