Могут ли организмы с одинаковым фенотипом иметь разный генотип? приведите примеры

Да, могут Например: А-доминантный признак, а - рецессивный. Организмы, имеющие генотипы Аа и АА будут обладать доминантным признаком фенотипически, но отличаться по генотипу.

Могут. Так как фенотип определяется генотипом, то вот ответ на ваш вопрос: однояйцевые близнецы. Они имеют одинаковый генотип, и если не будут стараться быть друг на друга непохожими, то и внешне(фенотипически) будут почти 100% идентичны друг  другу. Но если один из близнецов приложит усилия к изменению внешнего облика(от смены причёски до пластической операции), то при одинаковом  генотипе фенотипы уже будут разные.