На каком основании учёные считают, что голосеменные растения появились на Земле позже папоротников, плаунов, хвощей и мхов?

потому что у голосеменных появился ряд преимуществ: независимость оплодотворения от воды, образование семени. А как известно, эволюция идет по пути усложнения и совершенствования организмов.

в результате ароморфоза, то есть произошли изменения, которые повысили уровень их жизнедеятельности