"Содержит" почему "и", а не "е"? По правилу, если глагол н.ф. оканчивается на "ать" (содержать) пишется "е".

Потому что "содержать" образовано от слова "держать", которое является одним из четырёх на -ать и относится ко 2 спряжению. Поэтому и пишется "и"