Какую функцию выполняет надскорлупная обалочка в яйце?

Ответ на ваш вопрос предполагает длинную лекцию о зародышевых оболочках амниот! Коротко и грубо так: надскорлуповая - защита от бактерий и грибов

защита яйца от внешних повреждений.