Почему не все явления, которые происходят в природе можно назвать физическим?

Потому что во многих процессах ИЗМЕНЯЕТСЯ состав или строение молекул, что в физических процессах НЕ происходит. Поэтому "железо в воде покрывается ржавчиной ,растение растёт". То. это НЕ физические, а химические и биохимические явления. Физические: лёд тает, молния сверкает, гром гремит.