Почему некоторые имена существительные пишутся с прописной буквы в баснях??

Потому что они обозначают не существо, а общий образ существа определяющий все существа принадлежащие к этому имени. Это имя собственное существа, а оно пишется с большой буквы. Однажды Лебедь, Рак да Щука Везти с поклажей воз взялись И вместе трое все в него впряглись; Из кожи лезут вон, а возу все нет ходу! Поклажа бы для них казалась и легка: Да Лебедь рвется в облака, Рак пятится назад, а Щука тянет в воду. Кто виноват из них, кто прав - судить не нам; Да только воз и ныне там. И. А. Крылов фрагмент басни Лебедь, Рак и Щука. В этом отрывке мы видим что Лебедь это не имя обозначение птицы, а собирательный образ с одноименным определением.