Как восстановить "пробитую" манипуру?

Если сахасрара цела, о манипуре нечего беспокоиться, сама затянется.

Шпатлевкой замаш

скотчем заклеить

во-первых, что значит пробитую?) ) а во-вторых, практик по работе с чакрами куча, не ленитесь заглянуть в инет.